Menurut cerita yang turun menurun pada jaman dahulu desa Pagerwojo terdiri dari dua desa yaitu :
1.Desa Pagerweru
Bukti peninggalan Punden/Sarehan Kyai Tilas adalah orang yang pertama kali bubak alas desa tersebut. Untuk menandai batas wilayah Kyai Tilas menanami seluruh pinggiran desa dengan pohon weru atau waru, sehingga lama kelamaan tanaman weru yang tumbuh subur berubah menyerupai pager atau pagar. Dari situlah Nama Desa Pagerweru muncul dan ada sampai sekarang.
2. Desa Wonowojo
Bukti peninggalan berupa nama Sarehan Kyai Wonoboyo yang sampai sekarang ini masih dikeramatkan oleh warga masyarakat. Dahulu tempat tersebut adalah tempat penglerenan Kyai Wonoboyo selama dalam perjalanan di masa zaman kejayaan kerajaan Mataram.
Desa Pagerweru dan desa Wonowojo masing-masing diperintah oleh dua Kepala Desa tetapi pada zaman itu kedua desa tersebut selalu terlibat dalam perselisihan, meskipun tidak menimbulkan korban jiwa. Kemudian untuk meredam keributan yang terjadi terus-menerus diadakanlah musyawarah untuk mencapai mufakat yaitu menggabungkan dua desa dengan satu pemerintahan. Maka dinamailah desa baru tersebut dengan nama “PAGERWOJO”. Kata Pager diambil dari kata depan Pagerweru dan Kata Wojo diambil dari kata belakang wonowojo
Kemudian untuk memudahkan pelayanan kepada masyarakat, Desa Pagerwojo dibagi menjadi 6 dusun besar dan 2 dusun kecil yaitu :
a. Dusun : Mlaten
b. Dusun : Gedig
c. Dusun : Pagerweru
d. Dusun : Wonoboyo
e. Dusun : Tegalgunung
f. Dusun : Plalar
g. Dusun : Klumpit
h. Dusun : Krandon
Sejak terbentuknya Desa Pagerwojo pada tahun 1921 sampai dengan sekarang telah terjadi beberapa kali kepemimpinan yang terbagi dalam beberapa periode yaitu :
a. Periode I
Dari tahun 1921 sampai dengan 1945 kepimpinan Desa Pagerwojo dipegang oleh Ki Lurah Wongso Widjojo.
b. Periode II
Dari tahun 1945 sampai dengan 1947 kepimpinan Desa Pagerwojo dipegang oleh Lurah Goeroe Marijo.
c. Periode III
Dari tahun 1947 sampai dengan 1950 kepimpinan Desa Pagerwojo dipegang oleh Ki Lurah Wongso Widjojo.
d. Periode IV
Dari tahun 1951 sampai dengan 1975 kepemimpinan Desa Pagerwojo dipegang oleh Istiarjan
e. Periode V
Dari tahun 1975 sampai dengan 1985 kepemimpinan Desa Pagerwojo dipegang oleh RH Tono Singodiharjo
f. Periode VI
Dari tahun 1985 sampai dengan 1988 kepemimpinan Desa Pagerwojo dipegang oleh PJS Ridwan Darmawan
g. Periode VII
Dari tahun 1988 sampai dengan 1998 kepemimpinan Desa Pagerwojo dipegang oleh S. Miarso
h. Periode VIII
Dari tahun 1999 sampai dengan 2007 kepemimpinan Desa Pagerwojo dipegang oleh Suparlan
i. Periode IX
Dari tahun 2007 sampai dengan 2013 kepemimpinan Desa Pagerwojo dipegang oleh Rochmat
j. Periode X
Dari tahun 2013 sampai dengan 2019 kepemimpinan Desa Pagerwojo dipegang oleh Andik Budiyanto
k.Periode XI
Dari tahun 2019 sampai dengan 2020 kepemimpinan Desa Pagerwojo dipegang oleh PJS WPH Wijadmoko
l.Periode X11
Dari tahun l 2020 sampai dengan sekarang kepemimpinan Desa Pagerwojo di pegang oleh Yunianto
.jpeg)
